Решение вышестоящего налогового органа по налоговой проверке может быть самостоятельным предметом спора в суде, если это новое решение по проверке.
А также в случаях, когда налоговый орган нарушил процедуру его принятия или вышестоящий налоговый орган вышел за пределы своих полномочий (п. 75 Постановления Пленума ВАС РФ от 30 июля 2013 г. № 57). Такие разъяснения ФНС России опубликовала на своем официальном сайте.
Если же налогоплательщик не согласен с решением по жалобе по другим основаниям, то суды не признают их в качестве самостоятельного предмета спора.
Налоговое ведомство привело пример, когда ИП обратился в суд с требованием признать недействительным решение вышестоящего налогового органа, который частично отменил решение по камеральной налоговой проверке декларации по УСН (определение Верховного Суда Российской Федерации от 22 июня 2018 г. № 305-КГ18-7550).
При этом налогоплательщик полагал, что при принятии налоговым органом решения были допущены процессуальные нарушения, которые выражались в том числе в отсутствии оценки всех обстоятельств, имеющих значение для дела.
Суды отказали ИП, так как в данном случае решение вышестоящего налогового органа не может быть предметом отдельного спора. ФНС России приняла решение, частично отменяющее решения налоговой инспекции и которое не является новым решением по делу. Что касается действий вышестоящего налогового органа, то ВС РФ установил, что ФНС России не нарушила процедуру рассмотрения жалобы и не вышла за пределы своих полномочий.
Кроме того, в ходе судебного разбирательства установлено, что доводы налогоплательщика не соответствовали действительности.
ГАРАНТ.РУ: http://www.garant.ru/news/1223371/