Социальные вычеты по НДФЛ предоставляют работнику с месяца, когда он принес заявление в бухгалтерию (письмо Минфина России напомнил от 02.11.2017 № 03-04-06/72377).
То есть если работник принес заявление на социальный вычет в середине или даже в конце года, то пересчитывать налог с учетом вычета с начала календарного года не нужно. Норма о перерасчете распространяется только на имущественные вычеты.
Если с момента обращения за соцвычетом и до конца года доходов сотрудника не хватило, чтобы предоставить ему вычет целиком, за остатком работник обязан обратиться в ИФНС.
См. https://www.glavbukh.ru/news/26601-ndfl-po-sotsvychetu-pereschityvat-ne-nujno/